Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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PtprtQ99M80 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PtprtQ99M80 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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