Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gins4Q99LZ3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms