Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ctu1Q99J10 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ctu1Q99J10 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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