Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Snx18Q91ZR2 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snx18Q91ZR2 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Snx18Q91ZR2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snx18Q91ZR2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms