Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smg8Q8VE18 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg8Q8VE18 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Smg8Q8VE18 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg8Q8VE18 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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