Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nup58Q8R332 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nup58Q8R332 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nup58Q8R332 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nup58Q8R332 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nup58Q8R332 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms