Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fcho1Q8K285 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Fcho1Q8K285 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms