Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Phc3Q8CHP6 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Phc3Q8CHP6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Phc3Q8CHP6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Phc3Q8CHP6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Phc3Q8CHP6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Phc3Q8CHP6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Phc3Q8CHP6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Phc3Q8CHP6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Phc3Q8CHP6 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms