Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab11fip3Q8CHD8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rab11fip3Q8CHD8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab11fip3Q8CHD8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms