Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upp2Q8CGR7 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms