Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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