Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cdkl1Q8CEQ0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms