Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ccdc28aQ8CEI3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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