Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssxb2Q8C5Z3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms