Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
4933409G03RikQ8C5U0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms