Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms