Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC172989.1-201ENSMUST00000226387 513 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trim35Q8C006 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim35Q8C006 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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