Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Snx17Q8BVL3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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