Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gtf3c2Q8BL74 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms