Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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ChfrQ810L3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ChfrQ810L3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ChfrQ810L3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ChfrQ810L3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ChfrQ810L3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ChfrQ810L3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ChfrQ810L3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms