Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Amigo1Q80ZD8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Amigo1Q80ZD8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms