Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pcsk9Q80W65 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms