Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
LnpkQ7TQ95 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.1 ms