Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Usmg5Q78IK2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms