Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Topbp1Q6ZQF0 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms