Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Snx13Q6PHS6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Snx13Q6PHS6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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