Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CtifQ6PEE2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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