Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Zbtb40Q6PCS8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Zbtb40Q6PCS8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Zbtb40Q6PCS8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Zbtb40Q6PCS8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zbtb40Q6PCS8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zbtb40Q6PCS8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms