Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Clcn1Q64347 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Clcn1Q64347 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Clcn1Q64347 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Clcn1Q64347 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
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Clcn1Q64347 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Clcn1Q64347 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Clcn1Q64347 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Clcn1Q64347 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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