Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Surf4Q64310 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms