Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rai1Q61818 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rai1Q61818 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rai1Q61818 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rai1Q61818 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rai1Q61818 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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