Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pacsin1Q61644 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pacsin1Q61644 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pacsin1Q61644 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms