Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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Hcfc1Q61191 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hcfc1Q61191 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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