Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Klf3Q60980 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms