Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms