Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Tdrd5Q5VCS6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Tdrd5Q5VCS6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms