Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Tsr1Q5SWD9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tsr1Q5SWD9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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