Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trappc3lQ4KL14 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc3lQ4KL14 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms