Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnpc3Q3UZ01 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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