Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Gm27235Q3UW50 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms