Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
E130208F15RikQ3UPV3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms