Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Shisa3Q3UPR0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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