Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec31aQ3UPL0 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms