Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rnf224Q3UIW8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rnf224Q3UIW8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms