Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ccdc34Q3UI66 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc34Q3UI66 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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