Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Puf60Q3UEB3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms