Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Trafd1Q3UDK1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms