Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ulk3Q3U3Q1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms