Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hace1Q3U0D9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms