Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cwc27Q3TKY6 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cwc27Q3TKY6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms